El Paso Texas.- Suman Sirimulla, profesor asistente de Ciencias Farmacéuticas en UTEP (Universidad de Texas en El Paso por sus siglas en inglés), lidera un grupo de investigadores experimentales para desarrollar virtualmente la estructura molecular de un inhibidor de la proteasa que atacaría al Coronavirus, que causa COVID-19, una enfermedad respiratoria que puede propagarse de persona a persona.
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Se utilizan métodos computacionales, Sirimulla une pequeñas moléculas para crear inhibidores de proteínas virales, específicamente, inhibidores que se unirán a la proteína S o proteína de espiga del coronavirus y bloquearán su unión e infección de células sanas.
Las investigaciones que se realizan en la Facultad de Farmacia de la Universidad de Texas en El Paso para desarrollar vacunas y medicamentos antivirales para combatir el nuevo coronavirus podrían estar listas en un plazo de 15 meses a dos años, para que puedan utilizarse contra el COVID-19.
Los miembros de la Facultad de UTEP avanzan el descubrimiento del valor público, tenemos grandes expectativas para la investigación del Dr. Sirimulla y esperamos su desarrollo de terapias para combatir la nueva infección por Coronavirus dijo el Rectora de UTEP, Heather Wilson.
Sirimulla colabora con los miembros de la facultad de UTEP Nurunnabi, profesor asistente de Ciencias Farmacéuticas, y Manuel Llano, profesor asociado en el Departamento de Ciencias Biológicas y Tudor I. Oprea, profesor de medicina y jefe de la División de Informática Traslacional, Departamento de Medicina Interna de la Universidad de Nuevo México.
También desarrollan inhibidores de la proteasa principal del coronavirus, que es un objetivo atractivo debido a su papel esencial en el procesamiento de las poliproteínas que se traducen del ARN viral. Los científicos podrán usar el nuevo inhibidor de la proteasa para desarrollar medicamentos efectivos contra COVID-19.
El coronavirus se dirige a las enzimas ACE2 y TMPRSS2 de las células respiratorias y utiliza la proteína espiga para unirse a ellas, una vez que el virus ingresa a la célula, comienza a replicarse, lo que estamos tratando de hacer es apuntar a las enzimas ARN polimerasas dependientes de ARN del virus que participan en la replicación del virus dijo Sirimulla, un químico computacional con más de 10 años de experiencia en investigación de descubrimiento de fármacos.
Sirimulla ejecuta simulaciones a través del Centro de Computación Avanzada de Texas (TACC) del Sistema de la Universidad de Texas, que proporciona a los investigadores sistemas informáticos de alto rendimiento, visualización científica y almacenamiento de datos.
Sirimulla simulará la interacción entre las moléculas y las proteínas virales para comprender y refinar mejor el proceso de unión, también empleará algoritmos de inteligencia artificial que recomendarán qué moléculas usar.
El proceso para desarrollar un nuevo medicamento puede tomar hasta 10 años, sin embargo, debido a la urgencia de producir nuevas terapias farmacológicas para tratar COVID-19, Sirimulla dijo que pueden tener una vacuna o un medicamento antiviral listos en 15 meses a 2 años.
Los virólogos en UTEP y en otras universidades validarán los hallazgos de Sirimulla mediante procedimientos experimentales en sus laboratorios, mientras tanto, Llano dijo que desarrollará un ensayo que, en ausencia del virus, les permitirá probar las predicciones de Sirimulla.
Para acelerar el proceso de diseño, Sirimulla analiza grandes cantidades de moléculas, más de mil millones de compuestos, que pueden sintetizarse fácilmente y están disponibles a través de bibliotecas químicas en línea, su objetivo es encontrar moléculas que contengan compuestos que probablemente produzcan la respuesta biológica adecuada e inhiban la propagación del coronavirus.
Sirimulla también cuenta con la ayuda de voluntarios a través de BOINC @ TACC, un proyecto que integra la computación voluntaria y las supercomputadoras de TACC. Los voluntarios que se unan a BOINC @ TACC podrán ejecutar la aplicación de Sirimulla en sus computadoras y ayudarlo a explorar miles de millones de moléculas disponibles en las bibliotecas en línea.
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